日本计划在钓鱼岛附近的与那国岛部署自卫队，由于此地距离台湾花莲只有约110公里，因此触动了台海最敏感的神经。据台湾今日新闻3日消息，对此，台当局“外交部”亚东关系协会秘书长蔡明耀3日称，台日关系良好，相信驻军此举并非针对台湾。

日本媒体《东京新闻》报道称，防卫省考虑在东海争议岛屿附近的与那国岛部署自卫队。据了解，与那国岛位于台湾东部110公里，距离钓鱼岛只有约170公里，而目前日本最南端的部队部署是在冲绳的那霸，距离钓鱼岛约420公里。

与那国岛地位特殊，与大陆、台湾都非常接近，具有重要军事价值，去年6月美军两艘扫雷舰就特别停靠与那国岛港口，搜集台海情报，现在日本防卫省计划驻兵与那国岛，已经刺激到台海最敏感的神经。

国民党“立委”张显耀就指出，与那国岛正对苏澳港及佳山基地，日本驻军不仅引起台湾安全疑虑，也无助于钓鱼岛问题的解决。国民党“立委”林郁方则说，日本驻军后可能会压缩台湾在钓鱼岛海域的活动空间。

对于台湾各界的质疑，蔡明耀接受媒体访问时称，与那国岛是日本的领土，因此驻军与否外部无权干涉，而且台日关系良好，加上日本的假想敌不是台湾，所以此举不是针对台湾而来。